Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnga4Q3UW12 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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