Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ankrd27Q3UMR0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms