Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cops9Q3U898 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms