Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TTJ4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms