Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc102aQ3TMW1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms