Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm1123Q1RME4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms