Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms