Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc39dQ0VF76 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms