Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms