Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vps8Q0P5W1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vps8Q0P5W1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms