Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms