Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NrepQ07475 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms