Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdx4Q07424 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms