Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cxcr5Q04683 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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