Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Top2aQ01320 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Top2aQ01320 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms