Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gja5Q01231 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gja5Q01231 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms