Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx1P82976 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx1P82976 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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