Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irx1P81068 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx1P81068 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx1P81068 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Irx1P81068 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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