Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptprn2P80560 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptprn2P80560 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms