Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cxcr4P70658 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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