Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TspoP50637 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TspoP50637 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TspoP50637 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TspoP50637 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms