Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SftpbP50405 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms