Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod1P49813 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms