Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddit3P35639 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms