Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh15P33146 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh15P33146 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms