Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc1P29341 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms