Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf239P24399 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf239P24399 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms