Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd8P23463 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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