Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
P20040 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
P20040 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
P20040 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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