Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sdc1P18828 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms