Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18530 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18530 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P18530 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P18530 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P18530 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P18530 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P18530 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P18530 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms