Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cxcl9P18340 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cxcl9P18340 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms