Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Itgb1P09055 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Itgb1P09055 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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