Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TtrP07309 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TtrP07309 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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TtrP07309 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TtrP07309 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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