Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01748 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01748 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01748 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01748 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms