Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn4O70507 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms