Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms