Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Bnc1O35914 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Bnc1O35914 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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