Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Casq1O09165 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms