Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms