Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MttpO08601 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MttpO08601 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MttpO08601 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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MttpO08601 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MttpO08601 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MttpO08601 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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MttpO08601 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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