Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm20828J3KMI7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms