Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28305F6U473 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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