Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms