Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cspp1B2RX88 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms