Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2al1jA2BFR3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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