Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms