Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Top3bQ9Z321 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Top3bQ9Z321 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms