Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt27Q9Z320 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms