Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CcniQ9Z2V9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms